El sarampión es una enfermedad viral febril exantemática de alta transmisibilidad que representa un desafío constante para la salud pública internacional. A pesar de que Colombia logró la certificación como territorio libre de virus autóctonos en 2014 y ha revalidado este estatus de eliminación sostenida, los incrementos globales de casos y la movilidad migratoria generan un riesgo permanente de reintroducción dejando actualmente 15 casos importados de países como México y Estados Unidos. El presente artículo analiza cómo la vigilancia molecular, liderada por el Instituto Nacional de Salud (INS) y la Red Nacional de Laboratorios, permite diferenciar genotipos virales (como D8, B3 y D4) a través del análisis de la región N-450, rastrear fuentes de importación y fundamentar las acciones de contención epidemiológica.El sarampión es una infección eruptiva aguda provocada por un virus del género Morbillivirus (familia Paramyxoviridae), caracterizada por síntomas prodrómicos, manchas de Koplik y exantema maculopapular. El 22 de enero de 2014, la Comisión Internacional de Expertos declaró oficialmente a Colombia como un país libre de la circulación de virus autóctonos de sarampión y rubéola (Instituto Nacional de Salud [INS], 2024; Ministerio de Salud y Protección Social, 2014). Esta certificación de eliminación sostenida ha sido revalidada y verificada en múltiples evaluaciones ante la Organización Panamericana de la Salud (OPS) y la Organización Mundial de la Salud (OMS).

A pesar de este logro, las brechas en las coberturas globales de vacunación y la intensidad de los flujos migratorios regionales han originado la reemergencia de brotes en las Américas (Organización Panamericana de la Salud [OPS], 2026).

Ante la detección periódica de casos importados, las autoridades sanitarias colombianas mantienen una vigilancia epidemiológica intensificada para interceptar cadenas de transmisión y evitar el restablecimiento de focos endémicos (El Espectador, 2026; INS, 2024).

El genotipado y la epidemiología molecular (Gen N-450)

La OMS reconoce 24 genotipos filogenéticamente distintos del virus del sarampión. En un escenario de fase de post-eliminación, el diagnóstico serológico por sí solo resulta insuficiente para determinar el origen de un caso sospechoso (Revista de la Facultad de Medicina Humana, 2020). Por ello, la epidemiología molecular constituye una herramienta técnica determinante para distinguir si una infección corresponde a una cepa salvaje importada de otro país o a una reacción inmunológica esperada tras la aplicación de la vacuna atenuada.

El protocolo internacional estandarizado requiere la secuenciación de los 450 nucleótidos del extremo carboxilo terminal del gen de la nucleoproteína, región conocida como N-450 (INS, 2015, 2024). La resolución del análisis del gen N-450 permite rastrear variaciones genéticas minúsculas entre aislamientos virales. De este modo, si dos casos confirmados presentan diferencias nucleotídicas en este gen, la vigilancia virológica puede descartar un nexo epidemiológico directo o una cadena de contagio comunitaria local.

Distribución de genotipos y rastreo de importaciones

A nivel regional, la reemergencia del sarampión en las Américas ha estado impulsada de forma abrumadora por la circulación de los genotipos D8 y B3 (OPS, 2026; Revista de la Facultad de Medicina Humana, 2020). Específicamente, linajes como el MVi/HuluLangat.MYS/26.11 y el MVs/Gir Somnath.IND/42.16 han sido responsables de extensas cadenas de transmisión en el continente.

En Colombia, el monitoreo virológico ha respaldado el rastreo filogenético durante las contingencias sanitarias:

• Brotes históricos: En 2011, los casos secundarios detectados en la costa caribeña pertenecieron al genotipo D4 (INS, 2015).
• Contingencia 2018-2019: Tras el flujo migratorio procedentes de Venezuela y la llegada de viajeros de Europa y Brasil, la genotipificación de las muestras en Colombia confirmó la presencia dominante del genotipo D8 (linaje Hulu Langat) (INS, 2019).
• Vigilancia reciente (2026): En la evaluación de casos en zonas limítrofes como el Amazonas (Leticia), el diagnóstico molecular ha verificado que se trata de importaciones esporádicas de origen internacional, sin evidencia de transmisión comunitaria interna sostenida (El Espectador, 2026; OPS, 2026).

La Red Nacional de Laboratorios y métodos diagnósticos

El sistema diagnóstico en Colombia es coordinado por el Laboratorio Nacional de Referencia (LNR) del Grupo de Virología del INS, articulado con 11 Laboratorios Departamentales de Salud Pública (LDSP) distribuidos estratégicamente en capitales y zonas fronterizas (Atlántico, Bolívar, Norte de Santander, Santander, Antioquia, Risaralda, Caldas, Cundinamarca, Bogotá D.C., Valle y Nariño) (INS, 2015, 2024).

El algoritmo de laboratorio integra dos etapas diagnósticas obligatorias (INS, 2015):

1. Diagnóstico Serológico (ELISA): Captación inicial mediante la detección de anticuerpos IgM en suero. Frente a un resultado positivo o indeterminado, se solicita una segunda muestra pareada tomada entre 10 y 21 días después para evaluar la cuantificación y seroconversión de IgG o efectuar pruebas complementarias de avidez de IgG.
2. Detección Viral Directa (RT-PCR y Secuenciación): Muestras de secreción nasofaríngea o faríngea e hisopados acompañados de orina, recolectados en los primeros 7 días tras el inicio de la erupción, son procesadas por RT-PCR en tiempo real para extraer el ARN viral y proceder a la genotipificación en el INS.

Respuesta rápida, cercos epidemiológicos e inmunización
En la fase de eliminación, la confirmación virológica de un solo caso se clasifica inmediatamente como un brote de salud pública (INS, 2015, 2024). El protocolo exige desencadenar de forma simultánea las siguientes intervenciones en campo:

• Investigación Epidemiológica de Campo (IEC): Iniciada dentro de las primeras 48 horas posteriores a la notificación obligatoria al Sivigila.
• Búsqueda Activa Comunitaria (BAC): Cobertura manzana a manzana en un radio de 5 manzanas a la redonda de la vivienda del caso índice.
• Búsqueda Activa por Laboratorio (BAL): Tamizaje retroactivo de muestras de suero febriles exantemáticas con resultado negativo para dengue provenientes de zonas en silencio epidemiológico.

En el ámbito de la inmunización, el Programa Ampliado de Inmunizaciones (PAI) administra la vacuna triple viral (SRP) a los 12 meses y el refuerzo a los 18 meses de edad. Asimismo, como estrategia de contención en coyunturas de riesgo migratorio o territorial, se ejecuta la aplicación de la «dosis cero» en lactantes de 6 a 11 meses.

Conclusión

La vigilancia molecular del sarampión representa la garantía científica para sustentar el estatus de eliminación en Colombia (INS, 2024). Gracias a la secuenciación de la región N-450 del genoma viral y a la respuesta técnica del Instituto Nacional de Salud, el país no solo confirma diagnósticos con precisión, sino que demuestra de manera irrefutable que los casos identificados responden a eventos importados y no a cadenas ininterrumpidas de transmisión autóctona.

Bibliografía

• El Espectador. (2026, 15 de septiembre). Colombia intensifica la vigilancia del sarampión tras confirmar 15 casos importados. Redacción Salud. https://www.elespectador.com/salud/colombia-intensifica-la-vigilancia-del-sarampion-tras-confirmar-15-casos-importados/
• Instituto Nacional de Salud. (2015). Guía para la vigilancia por laboratorio de sarampión y rubéola. Dirección de Redes en Salud Pública, Grupo de Virología. https://www.ins.gov.co/buscador-eventos/Informacin%20de%20laboratorio/guia-para-la-vigilancia-por-laboratorio-de-sarampion-y-rubeola.pdf
• Instituto Nacional de Salud. (2019). Informe de evento: Sarampión y rubéola, Colombia, 2019. Dirección de Vigilancia y Análisis del Riesgo en Salud Pública. https://www.ins.gov.co/buscador-eventos/Informesdeevento/SARAMPI%C3%93N-RUB%C3%89OLA_2019.pdf
• Instituto Nacional de Salud. (2024). Protocolo de vigilancia en salud pública: Sarampión y rubéola (Versión 06). Ministerio de Salud y Protección Social. https://www.ins.gov.co/buscador-eventos/Lineamientos/Pro_Sarampi%C3%B3n_Rubeola.pdf
• Organización Panamericana de la Salud. (2026). Informe de situación regional N.º 3: Sarampión en la Región de las Américas. Organización Mundial de la Salud. https://www.paho.org/sites/default/files/2026/05/sarampion-brote-multipais-informe-situacion-no3-21mayo-2026-es.pdf
• Revista de la Facultad de Medicina Humana. (2020). Epidemiología molecular del virus del sarampión en la región de las Américas: Panorama actual. Universidad Ricardo Palma, 20(4). https://revistas.urp.edu.pe/index.php/RFMH/article/view/2966/3195